本实用新型涉及一种试管自动清洁机构，包括试管、下料单元、清洁单元；下料单元设置在清洁单元的上方，下料单元可下降至清洁单元内部；下料单元包括下料试管架、托板和夹紧机构；所述夹紧机构设置在下料试管架上方，用于夹紧各试管；所述下料试管架放置在托板上。本装置采用集中式试管清洁单元，整个系统采取下沉式结构，集中式清洗，可以保证清洗时试剂及清洗液不会洒落在工作台面上，保证操作区的清洁卫生；本系统的清洗仓有废液回收接口，废液回收接口与用户的储存器或特殊下水相连，方便废液的收集和处理，安全环保。样品管可自动从下料单元转移到清洁单元进行清洗，清洁单元可实现一次性清洗大批量样品管，清洗效率极高。